UbiCARE

Understanding Ubiquitin Regulated processes implicated in Cancer

Notre équipe étudie les mécanismes régulés par les molécules de la famille Ubiquitine (UbLs) impliqués dans le développement du cancer. Nous cherchons à comprendre le rôle des modifications post-traductionnelles (PTM), les mécanismes en découlant impliqués dans la résistance aux traitements de chimiothérapie et à évaluer le potentiel de certaines molécules en tant que biomarqueur et/ou cible pharmacologique.

 

Nous explorons plus particulièrement le remodelage des chaînes d’ubiquitine et le rôle de certaines enzymes de cette famille. Nous avons ainsi commencé par étudier la résistance au Bortezomib dans des modèles de lymphomes du manteau et de leucémie aigüe myéloïde. Pour répondre à toutes ces questions, notre groupe développe des pièges moléculaires pour isoler, identifier, quantifier et analyser individuellement les protéines ou évènements cellulaires généraux régulés par ces PTM. Nos approches dérivent de la nécessité d’obtenir des outils efficaces pour explorer le rôle des ubiquitines dans le contrôle des protéines endogènes que ce soit grâce à des cultures cellulaires, des modèles animaux ou des  échantillons de patients.

Chef d'équipe

Manuel Rodriguez

Laboratoire partenaire

IPBS

Autres informations

Sélection de références
  • Valérie Lang, Fabienne Aillet, Wendy Xolalpa, Sonia Serna, Laurie Ceccato, Rosa G. Lopez-Reyes, Maria Paz Lopez-Mato, Radosław Januchowski, Niels-Christian Reichardt,  Manuel S. Rodriguez. (2017) Analysis of defective protein ubiquitylation associated to adriamycin resistant cells. Cell cycle sous presse
  • Serna S., Xolalpa W., Lang V., Aillet F., England P., Reichardt N., and Rodriguez MS. Efficient Monitoring of Protein Ubiquitylation Levels using TUBEs-based Microarrays. FEBS letters 2016 Aug;590(16):2748-56.
  • Mata-Cantero L., Azkargorta M, Aillet F., Xolalpa W., LaFuente MJ, Elortza F., Carvalho AS., Martin-Plaza J., Matthiesen R, and Rodriguez MS. New insights into host-parasite ubiquitin proteome dynamics in P. falciparum infected red blood cells using a TUBEs-MS approach . J Proteomics Apr 29, 2016;139:45-59.
  • Rodriguez MS (Ed), et al  SUMO Methods and Protocols. Methods Mol Biol. 1475, Springer  2016
  • Mata-Cantero L, Cid C, Gomez-Lorenzo MG, Xolalpa W, Aillet F, Martín JJ, Rodriguez MS. Development of two novel high-throughput assays to quantify ubiquitylated proteins in cell lysates: application to screening of new anti-malarials. Malar J. 2015 May 14;14:200.
Membres de l'équipe
  • Manuel S. RODRIGUEZ (CR1-CNRS)
  • Laurie BONNAFE (IE CDD-CNRS)
  • Rosa LOPEZ-REYES (PhD CONACyT)
  • Grégoire QUINET (PhD M.E.S.R.I.)
  • Clémence COUTELLE-REBUT (Manager de projet européen)
Collaborations
  • Carmen Rivas, USC, Santiago de Compostela, ES,
  • Gael Roué, IDIBAPS-Hospital Clinic of Barcelona, ES,
  • Dimitris Xirodimas, CRBM-CNRS, Montpellier, FR (ITN UbiCODE),
  • Jean-Emmanuel Sarry, CRCT Toulouse, FR,
  • Pierre Lutz, IPBS Toulouse, FR,
  • Rosa Barrio, CIC bioGUNE, Bilbao, ES (ITN UbiCODE),
  • Niels Reichardt, CIC biomaGUNE, San Sebastian, ES,
  • Ron Hay, University of Dundee, Scotland, UK (ITN UbiCODE),
  • Rune Mathiesen, Nova Medical School, Lisboa, PT (ITN UbiCODE),
  • Jean Christophe Rain, Hybrigenics, Paris, FR (ITN UbiCODE).

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